宏基因组测序
宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落 结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。
应用方向:人体或动物微生态及其与疾病关联:如肠道菌群,皮肤菌群,口腔菌群,肥胖、糖尿病、癌症等患者肠道微生物;
自然环境微生态:如作物根系或受污染等土壤微生物,海洋、冰川、污水等水体微生物;
工业环境微生态:如食品发酵液、酸性工业废水、污泥处理器等微生物多样性,以及产甲烷菌、硝化 / 反硝化细菌的功能基因研究;
食品或药品的微生物安全检测。
实验原理
其实验流程主要是:核酸提取和片段化,建库测序和生信分析。
服务内容
提供从样本提取、建库测序和生信分析的一站式服务。
样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3g | 1g |
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) | 3张 | 1张 |
空气滤膜(直径种类多,与采样器搭配,有明显颜色沉淀在滤膜上) | 3张 | 1张 |
拭子 | 5-10个 | 3个 |
瘤胃液/发酵液/组织液/冲洗液(离心有明显沉淀) | 3-5mL,沉淀1g | 1mL,沉淀0.5g |
粪便/肠道内容物 | 2g(小鼠6-10粒) | 0.5g(小鼠3粒) |
动物/人组织 | 1g | 0.5g |
牛奶/酸奶 | 30mL/50g | 10mL/5g |
食糜 | 2g | 1g |
食品表面拭子 | 10个 | 5个 |