宏基因组测序

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落 结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。

应用方向:人体或动物微生态及其与疾病关联:如肠道菌群,皮肤菌群,口腔菌群,肥胖、糖尿病、癌症等患者肠道微生物;

自然环境微生态:如作物根系或受污染等土壤微生物,海洋、冰川、污水等水体微生物;

工业环境微生态:如食品发酵液、酸性工业废水、污泥处理器等微生物多样性,以及产甲烷菌、硝化 / 反硝化细菌的功能基因研究;

食品或药品的微生物安全检测。

实验原理

其实验流程主要是:核酸提取和片段化,建库测序和生信分析。


宏基因组测序.png 

   

服务内容

提供从样本提取、建库测序和生信分析的一站式服务。


样本类型

建议送样量

最低送样量

土壤/污泥/沉积物/腐殖质

3g

1g

水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm)

3张

1张

空气滤膜(直径种类多,与采样器搭配,有明显颜色沉淀在滤膜上)

3张

1张

拭子

5-10个

3个

瘤胃液/发酵液/组织液/冲洗液(离心有明显沉淀)

3-5mL,沉淀1g

1mL,沉淀0.5g

粪便/肠道内容物

2g(小鼠6-10粒)

0.5g(小鼠3粒)

动物/人组织

1g

0.5g

牛奶/酸奶

30mL/50g

10mL/5g

食糜

2g

1g

食品表面拭子

10个

5个